MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 3592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018001	T	6	6	31	36	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018001	A	6	6	48	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018001	CCGG	2	8	59	66	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018001	A	6	6	190	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018001	GT	3	6	271	276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018001	TTA	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018001	AT	4	8	2093	2100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018001	CCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018001	CGC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018001	AGTA	2	8	4195	4202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018001	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018001	CCCG	2	8	4271	4278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_018001	A	6	6	4334	4339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018001	ATA	2	6	5993	5998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018001	AT	4	8	6001	6008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018001	ATA	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018001	ATT	2	6	6034	6039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018001	AAT	2	6	6054	6059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018001	TA	3	6	6069	6074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018001	GATA	2	8	6080	6087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018001	AAAT	2	8	7538	7545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018001	AAC	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018001	TAA	2	6	9336	9341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018001	TAA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018001	GGT	2	6	11980	11985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018001	CTA	2	6	11998	12003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018001	CTA	2	6	12010	12015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018001	CT	3	6	12016	12021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018001	ATATC	2	10	12081	12090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018001	CCG	2	6	12120	12125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018001	AAG	2	6	12175	12180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018001	AAT	2	6	12267	12272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018001	TAT	2	6	12290	12295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018001	ATCT	2	8	12391	12398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018001	TA	3	6	12664	12669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018001	TG	3	6	12743	12748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018001	ACC	2	6	13299	13304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018001	AT	3	6	13331	13336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018001	AAT	2	6	13339	13344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018001	TTA	2	6	13470	13475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018001	TGC	2	6	13555	13560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018001	ATA	2	6	13654	13659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018001	ACA	2	6	13708	13713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018001	CAT	2	6	13748	13753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018001	TAT	3	9	13780	13788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018001	AAT	2	6	13789	13794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018001	TGT	2	6	13959	13964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018001	ATA	2	6	13982	13987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018001	ATTAT	2	10	14012	14021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018001	ATA	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018001	ATT	2	6	14068	14073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018001	AAT	2	6	14103	14108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018001	TCA	2	6	14232	14237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018001	AGGA	2	8	17758	17765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018001	A	6	6	17772	17777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018001	TCT	3	9	17782	17790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018001	ATG	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018001	TA	3	6	19060	19065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018001	GCCC	2	8	19111	19118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_018001	GAA	2	6	19129	19134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018001	T	6	6	20168	20173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018001	AAT	2	6	20181	20186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018001	AGG	2	6	20193	20198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018001	CGG	2	6	20688	20693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018001	ATA	3	9	20694	20702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018001	CAT	2	6	20777	20782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018001	CAA	2	6	20838	20843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018001	ATGG	2	8	20867	20874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018001	GATG	2	8	20999	21006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018001	GAG	2	6	21041	21046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018001	TCC	2	6	22907	22912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018001	A	6	6	22946	22951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018001	GTG	2	6	22956	22961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018001	GGA	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018001	TTA	2	6	24868	24873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018001	TAA	2	6	25700	25705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018001	CCT	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018001	TAG	2	6	25748	25753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018001	GTCAA	2	10	25775	25784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018001	GGC	2	6	25812	25817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018001	TAT	2	6	25859	25864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018001	GCT	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018001	GTTTT	2	10	25897	25906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018001	ATA	2	6	25909	25914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018001	TTGG	2	8	25923	25930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018001	TGT	2	6	25931	25936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018001	CGT	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018001	CAT	2	6	25982	25987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018001	CAAC	2	8	26038	26045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018001	ATA	2	6	26075	26080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018001	AGA	2	6	26091	26096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018001	AAT	2	6	26103	26108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018001	GCTTCG	2	12	26134	26145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018001	ATG	2	6	26179	26184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018001	TCA	2	6	26188	26193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018001	CAT	2	6	26219	26224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018001	TGT	2	6	26325	26330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018001	TCA	2	6	26344	26349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018001	TCCA	2	8	26388	26395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018001	ATG	2	6	26541	26546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018001	TTC	2	6	26555	26560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018001	AAC	2	6	26569	26574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018001	TTC	2	6	26630	26635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018001	TTC	2	6	26645	26650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018001	ATT	2	6	26681	26686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018001	TCA	2	6	26737	26742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018001	TGA	2	6	26771	26776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018001	TC	3	6	26810	26815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018001	TTC	2	6	26829	26834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018001	TAT	2	6	26844	26849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018001	GCT	2	6	26889	26894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018001	CAC	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018001	AT	3	6	30171	30176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018001	TGC	2	6	30543	30548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018001	TTAT	2	8	30608	30615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018001	ATC	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018001	CTT	2	6	31957	31962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018001	G	6	6	33406	33411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018001	TAAT	2	8	33513	33520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018001	TA	3	6	33561	33566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018001	GCG	2	6	33572	33577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018001	GGTTAA	2	12	33578	33589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018001	ATGA	2	8	33604	33611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018001	TCT	2	6	34175	34180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018001	AAT	2	6	34237	34242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018001	AG	3	6	37446	37451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018001	T	9	9	37812	37820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018001	CAAT	2	8	37878	37885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018001	GGT	2	6	37929	37934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018001	TATT	2	8	38307	38314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018001	TAG	2	6	38333	38338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018001	GAT	2	6	40713	40718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018001	TAT	2	6	41146	41151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018001	TAA	2	6	41177	41182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018001	ATGT	2	8	41224	41231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018001	GCC	3	9	41252	41260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018001	TAC	2	6	41314	41319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018001	GGC	2	6	41320	41325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018001	TCT	2	6	42373	42378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018001	TAAA	2	8	44441	44448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018001	CCT	2	6	44467	44472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018001	AT	3	6	44481	44486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018001	ATT	2	6	44488	44493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018001	TG	3	6	46458	46463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018001	GTA	3	9	46480	46488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018001	ATT	2	6	47081	47086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018001	TCCA	2	8	47121	47128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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432	NC_018001	ATT	2	6	145221	145226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_018001	TAA	2	6	168563	168568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_018001	AAGAT	2	10	169182	169191	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
467	NC_018001	TAA	2	6	169197	169202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_018001	ATA	2	6	179211	179216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018001	TTA	2	6	179220	179225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_018001	AGT	2	6	179312	179317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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